La Dirección de Contraloría Interna tiene las siguientes funciones:

• Vigilar el cumplimiento de las normas de control y demás disposiciones aplicables y las relativas al funcionamiento administrativo y financiero del Poder Judicial, a través de auditorías y verificaciones; formulando las observaciones o recomendaciones correspondientes, a efecto de implementar las medidas preventivas y correctivas.
• Participar en el Comité de Adquisiciones, Enajenaciones, Arrendamientos y Contratación de Servicios del Poder Judicial.
• Llevar a cabo las investigaciones en materia de Responsabilidad Administrativa de los Servidores Públicos, relativas al funcionamiento administrativo y financiero.
• Recibir y registrar las declaraciones patrimoniales de los servidores públicos.

• Establecer los criterios y técnicas para la estructura y contenido de manuales administrativos.
• Recibir las cartas de no conflicto de intereses, de conformidad con lo dispuesto por la Ley General de Responsabilidades Administrativas.
• Intervenir en los procesos de entrega recepción de las áreas de apoyo a la función jurisdiccional y áreas administrativas.

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